این رشته پایه و اساس علم تمرین به‌ شمار آمده و یکی از قدیمی‌­ترین رشته‌­های علوم ورزشی به حساب می­‌آید. چگونگی برنامه‌­نویسی تمرینات ورزشی بر اساس شاخص­‌های انداز‌‌ه‌­گیری شده افراد برای میل به موفقیت و اهداف ورزشی خاص، بررسی تاثیر ورزش به سطح بافت سلول و مولکول، استعدادیابی ورزشی( ترکیب­ بندی)، تغذیه ورزشی و متابولیسم مختص به این رشته می­ باشد.​​​​​​

 گرایش­‌های این رشته:

1.  فیزیولوژی فعالیت بدنی و تندرستی
2. فیزیولوژی ورزشی کاربردی
3. فیزیولوژی فعالیت بدنی محض
4. فیزیولوژی فعالیت بدنی بالینی
5.  تغذیه ورزشی

                هدف از تأسیس دوره کارشناسی ارشد رشته فیزیولوژی ورزشی عبارت است از پرورش افراد سرآمد و متخصص در حوزه فیزیولوژی ورزشی تا بتوانند به آموزش، برنامه ریزی، اجرا و راهنمایی و تحلیل مشکلات و پژوهشی در این رشته بپردازند و با تولید یافته‌های جدید علمی درگسترش هرچه بیشتر مبانی فیزیولوژی ورزشی و توسعه مرزهای دانش در حوزه مذکور نائل آیند. 

                دانشگاه­‌هایی که در این رشته پذیرش دارند عبارتند از: اراک، بجنورد، تربیت دبیر شهید رجایی، خوارزمی، رازی کرمانشاه، سمنان، شاهد تهران، شهید مدنی آذربایجان، صنعتی شاهرود، فردوسی مشهد، گیلان، لرستان، الزهرا، بوعلی سینا، بیرجند، تبریز، تهران، حکیم سبزواری، زنجان، سیستان و بلوچستان، شهرکرد، شهید چمران، شیراز، علامه طباطبایی، محقق اردبیلی، اصفهان، قم، کردستان، باهنر، مازندران و بین­ المللی امام خمینی (ره).

                دانشجویان مقطع کارشناسی ارشد در این رشته جمعا 32 واحد می‌گذرانند که از این بین 6 واحد دروس انتخابی، 14 واحد دروس اختصاصی، 6 واحد دروس پایه و 6 واحد پایان نامه می­‌باشد. دروس اختصاصی و پایه گذرانده شده در این رشته عبارتند از:

                در گرایش کاربردی: اصول برنامه‌ریزی تمرین و فعالیت ورزشی، فیزولوژی انسان پیشرفته ویژه فعالیت ورزشی، آمار زیستی، متابولیسم فعالیت ورزشی و تمرین، برنامه‌ریزی پیشرفته ویژه قدرت و استقامت، روش تحقیق در علوم ورزشی، استرس محیطی در تمرین و فعالیت ورزشی، بدنسازی ویژه رشته­‌های ورزشی، سمینار، استفاده و سواستفاده از داروهای اختیاری، تغذیه ورزشی پیشرفته، تکنیک‌­های آزمایشگاهی و موضوعات پیشرفته در فیزولوژی ورزشی.

                در گرایش محض: آناتومی ویژه فعالیت ورزشی، فیزیولوژی انسان پیشرفته، آمار زیستی، بیوشیمی و متابولیسم فعالیت ورزشی، تغذیه، روش تحقیق، فیزیولوژی پیشرفته، تکنیک­‌های آزمایشگاهی، فیزیولوژی ورزشی بالینی، سمینار، فیزیولوژی ورزش کودکان و نوجوانان، فیزیولوژی ورزش کاربردی و ایمونولوژی.

                دانشجویان در مقطع دکتری در این رشته جمعه 36 واحد می‌گذرانند که 6 واحد اختیاری، 8 واحد دروس اختصاصی، 4 واحد دروس پایه و 18 واحد رساله دکتری می‌­باشد که کلیه درس به جز رساله دکتری عبارتند از:

                در گرایش بیوشیمی و متابولیسم ورزشی: آمار و روش تحقیق پیشرفته در فیزیولوژی ورزشی، سازگاری سلولی با فعالیت ورزشی، بیوشیمی ورزشی پیشرفته، جنبه­‌های متابولیک فعالیت ورزشی، پاسخ‌­های هورمونی به فعالیت ورزشی، پاسخ‌­های ایمنی به فعالیت ورزشی، پاسخ­‌های ایمنی به فعالیت ورزشی، سمینار، روش­‌های آزمایشگاهی بیوشیمی و متابوبیسم ورزشی و اختلالات متابولیک و فعالیت ورزشی.

                در گرایش قلب و عروق و تنفس: آمار و روش تحقیق پیشرفته در فیزیولوژی ورزشی، فیزیولوژی ورزشی پیشرفته قلب و عروق، بیوشیمی ورزشی پیشرفته، فیزیولوژی پیشرفته قلب وعروق و تنفس، سازگاری سلولی با فعالیت ورزشی، فیزیولوژی ورزشی پیشرفته تنفس، روش‌­های آزمایشگاهی سنجش عملکرد قلب و عروق و تنفس در ورزش و مطالعه هدایت شده.

                دکتر فرزاد ناظم، دکتر حیدریان­‌پور، دکتر حسام پارسا، دکتر سمواتی(بازنشسته) اساتید هیئت علمی دانشگاه بوعلی در رشته فوق می­‌باشند.